【行業(yè)新聞】使用MassARRAY對(duì)NSCLC中體細(xì)胞突變進(jìn)行高度敏感的評(píng)估

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時(shí)間：2017-09-29 11:18

近日，Agena Bioscience宣布在PLOS ONE發(fā)表了一項(xiàng)比較研究，強(qiáng)調(diào)使用其基于質(zhì)譜平臺(tái)和新的高度靈敏的iPLEX?HS化學(xué)物質(zhì)檢測(cè)發(fā)生在非小細(xì)胞肺癌（NSCLC）EGFR、KRAS、BRAF和NRAS的體細(xì)胞突變。

　　肺癌通常使用微創(chuàng)技術(shù)進(jìn)行活檢，如薄針狀活檢和細(xì)胞學(xué)細(xì)胞塊，其導(dǎo)致具有最小腫瘤組織的小的異質(zhì)樣品標(biāo)本。大多數(shù)技術(shù)如Sanger測(cè)序和NGS需要至少20-40％的腫瘤含量來(lái)檢測(cè)低至5％-20％變異等位基因頻率（VAF）的突變。因此，由于腫瘤含量不足，使樣品不合格。

　　該研究證明，使用Agena Bioscience的iPLEX HS Lung Panel測(cè)試來(lái)自醫(yī)學(xué)基金會(huì)的179個(gè)存檔NSCLC臨床標(biāo)本，具有1％的VAF檢測(cè)限和僅5-10ng的輸入DNA。已經(jīng)使用Agena Bioscience的OncoFOCUS?v2.0或v3.0面板在MassARRAY系統(tǒng)上測(cè)試了EGFR，KRAS，NRAS和BRAF的突變標(biāo)本，具有5-10％VAF的檢測(cè)限。鑒于iPLEX HS化學(xué)物質(zhì)的敏感性增加，鑒定到先前未檢測(cè)到的KRAS，NRAS，BRAF和EGFR的另外17個(gè)突變（或9.5％以上的突變）。這些額外的突變主要在核心針活檢和細(xì)胞學(xué)細(xì)胞塊中檢測(cè)到。

　　iPLEX?HS Lung Panel在MassARRAY系統(tǒng)上運(yùn)行，使用擴(kuò)增和單堿基擴(kuò)增，隨后在質(zhì)譜儀上進(jìn)行分析。根據(jù)樣品中的野生型信號(hào)，延伸反應(yīng)中消耗野生型終止子，并將突變信號(hào)的量化終止至非常低的等位基因頻率，可以實(shí)現(xiàn)更高的靈敏度。

　　Agena Bioscience科學(xué)事務(wù)高級(jí)總監(jiān)Darryl Irwin博士說(shuō)：“iPLEX HS Lung面板的檢測(cè)限度和DNA輸入要求不斷增加，成為用于檢測(cè)腫瘤含量有限的NSCLC標(biāo)本的理想選擇?！?/p>

　　醫(yī)學(xué)基金會(huì)表示，“此外，由于8小時(shí)的周轉(zhuǎn)時(shí)間和每個(gè)樣本成本低，我們可以對(duì)具有較高檢測(cè)水平的更多樣本進(jìn)行目標(biāo)篩選，從而潛在地在早期階段發(fā)現(xiàn)突變?！?/p>

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